自2006年下半年起，针对药品研制环节的大规模专项整治工作在全国全面铺开。药品文号正在经历全面清理，SFDA摸清了17.6万个药品批准文号的底数。文号清查基本结束，接下来是药品再注册。

2007年，将有数万种药品批准文号陆续满5年，进入再注册行列。“这是法定的。”颜江瑛说。再注册数量之所以集中，缘于2002年，当时推行地标升国标新亚，药品审批权收归国家局。

这项郑筱萸强力推行的制度，他自己却没有严格执行，他被判处死刑的一项罪名是“玩忽职守”——一些不应该换发文号或应予撤销批准文号的新药品获得了文号，其中6种竟然为假药。

药监系统官员称，这是解决“历史遗留问题”。SFDA的最初数据显示，到6月底，全国共撤回药品注册申请6441个，撤回率为21.9％；注销了578个文号。

“清理文号，淘汰一批；再注册又要淘汰一批。”相关人士透露，由于这次清理比以前更加严格，不少企业选择了自动撤回注册申请。

新药的审批仍在继续，但能通过的比往年少了很多。“一年万种新药”的剧烈批评使现在的新药审批通过率大大缩水，仿制药的命运更糟糕，“会有一些药厂在这轮监管中被淘汰出局”。